Первая аптека в России была открыта в 1581 году в Кремле напротив Чудова монастыря. Эта аптека, обслуживавшая только царскую семью, находилась в специальном помещении и была обставлена роскошной мебелью. Аптечная посуда была изготовлена из шлифованного хрусталя, а некоторые изделия из серебра. Отпуск лекарств из аптеки был регламентирован и подвергался строжайшему контролю. Лекарства «пристойные»… великого государя хранились в специальной кладовой, так называемой «казенке», куда без дьяка никто не мог входить, в том числе и аптекарь.
   Лекарства изготавливались в особом помещении и только по рецептам, которые имели царскую резолюцию: «то лекарство составя приготовить». В специальной книге записывались рецепт и имена лиц, приготовивших лекарство и получивших его для передачи во дворец. Прежде чем дать лекарство царю, его должны были пробовать («надкушать») врач и аптекарь.
   Вторая аптека «новая аптека» была открыта в Москве в 1672 году. Она продавала лекарства людям всех чинов по «указной книге». В указе об открытии этой аптеки говорится: «…на новом Гостином дворе, где приказ большого приходу, очистить палаты, а в тех палатах указал великий государь построить аптеку для продажи всяких лекарств, всяких чинов людям по указной книге».
    Для руководства медицинским делом в России был организован Аптекарский приказ. В его задачу входило наблюдение за лечением царя и его семьи, за лекарствами, приготовляемыми в царской аптеке, а также за деятельностью приглашаемых врачей-иностранцев. Позднее Аптекарский приказ стал государственным административным учреждением, ведавшим всем медицинским и аптечным делом в России. Точная дата создания Аптекарского приказа не установлена. Считают, что он был создан в конце XVI или начале XVII века.